公司出售自建工业厂房的税费需依具体情况计算：
1、自建自用厂房转让，需缴增值税、土地增值税、企业所得税等；
2、不动产转让增值税率13%，可能涉及附加税费；
3、一般纳税人可抵扣部分进项，实际税负或降低；
4、厂房转让有增值，需缴土地增值税；
5、企业所得税按转让所得并入应纳税所得额，依适用税率缴纳；
6、不同地区或有税收优惠，可依法申请减免或递延。
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公司出售自建工业厂房时，常见错误操作易引税务风险：
1、低价转让减税费，若价格明显低于市场价，税务机关可依《税收征收管理法》调整，需补税、滞纳金甚至罚款；
2、不核实厂房权属及历史成本，缺乏原始凭证会致土地增值税扣除项目难确认，增加税负；
3、忽视地方税收优惠政策，部分地区对厂房转让有减免或返还政策，未及时申请会多缴税。为避免，建议交易前咨询专业人士，确保流程合规高效。
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公司出售自建工业厂房可能面临以下法律风险：
1、税务机关调整转让价格，若价格远低于市场价，税务机关有权依《税收征收管理法》第三十五条核定调整，需补税、滞纳金甚至行政处罚；
2、企业所得税计算错误或致处罚，如错误归类转让所得或未及时申报，可能被认定为偷税，面临罚款及信用受损。例如某公司未申报厂房转让收入，被稽查后补缴税款并被处1倍罚款。
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公司出售自建工业厂房的税费计算需依据相关法律条款：根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第一条，销售不动产属增值税应税行为，税率13%。一般纳税人购进时取得合法增值税专用发票，可抵扣进项，实际应纳税额=销项-进项。同时，《中华人民共和国土地增值税暂行条例》第二条规定，转让国有土地使用权、地上建筑物及其附着物并取得收入的单位和个人，需缴纳土地增值税，按增值额四级超率累进税率计算（增值额≤扣除项目50%，税率30%；50%-100%，40%；100%-200%，50%；＞200%，60%）。此外，《企业所得税法》第六条规定，企业转让财产所得计入应纳税所得额，一般企业按25%税率计税。因此，需综合上述税费适用情况计算。

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